حفره دهان انسان دارای تعداد زیادی میکروارگانیسم است که به سرعت تکثیر میشوند. پوسیدگی دندان توسط همین میکروارگانیسمها بر روی بافتهای سخت دندان ایجاد میشود. باکتریهای موجود در دهان شامل استرپتوکوکها، لاکتوباسیلها و اکتینومایستها هستند که معمولاً از بدو تولد از مادر به کودک منتقل میشوند.